กระทรวงสาธารณสุขโดย กรมการแพทย์ให้ความร่วมมือกับคณะแพทยศาสตร์ มหาวิทยาลัยรังสิตในการฝึกอบรมนักศึกษาแพทย์ มหาวิทยาลัยรังสิต โดยร่วมกันจัดตั้งสถาบันร่วมผลิตแพทย์ระหว่างกรมการแพทย์และมหาวิทยาลัยรังสิต เพื่อดำเนินการในการจัดการเรียนการสอนในภาควิชาคลินิก (ชั้นปีที่ ๔ , ๕ และ ๖) โดยเริ่มที่โรงพยาบาลราชวิถี ในปี พ.ศ. ๒๕๓๔ และโรงพยาบาลเลิดสินในปี พ.ศ. ๒๕๕๔ 

ด้วยศักยภาพและความพร้อมของโรงพยาบาลนพรัตราชธานี กรมการแพทย์ พิจารณาแล้วจึงได้อนุมัติให้โรงพยาบาลนพรัตนราชธานีเป็นโรงพยาบาลหลักในโครงการร่วมผลิตแพทย์ระหว่างกรมการแพทย์กับมหาวิทยาลัยรังสิต จึงได้ลงนามบันทึกข้อตกลงความร่วมมือในการร่วมผลิตแพทย์ของโรงพยาบาลนพรัตนราชธานี กับ มหาวิทยาลัยรังสิต เมื่อวันที่ ๒๓ กรกฎาคม พ.ศ. ๒๕๕๘ จะเป็นไปในทำนองเดียวกันกับโรงพยาบาลราชวิถีและโรงพยาบาลเลิดสิน ซึ่งคาดว่า จะรับนักศึกษาแพทย์ได้ในปี พ.ศ. ๒๕๖๗ จำนวน ๒๕ คน เพื่อช่วยบรรเทาการขาดแคลนแพทย์ของกระทรวงสาธารณสุขได้